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Bactéries responsables de la diarrhée adaptées à la propagation dans les hôpitaux – Newstrotteur

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Les scientifiques ont découvert que la bactérie infectant l'intestin Clostridium difficile évolue en deux espèces distinctes, avec un groupe hautement adapté pour se propager dans les hôpitaux. Des chercheurs du Wellcome Sanger Institute, de la London School of Hygiene & Tropical Medicine et de leurs collaborateurs ont identifié des modifications génétiques chez les espèces émergentes, leur permettant de s’épanouir avec le régime alimentaire occidental riche en sucre, d’éviter les désinfectants hospitaliers courants et de se répandre facilement. Capable de provoquer une diarrhée débilitante, ils ont estimé que cette espèce émergente a commencé à apparaître il y a des milliers d'années et représente plus des deux tiers des soins de santé. C. difficile les infections.

Publié dans Nature Genetics aujourd'hui (12 août), la plus grande étude génomique jamais réalisée sur C. difficile montre comment les bactéries peuvent évoluer vers une nouvelle espèce et démontre que C. difficile continue d'évoluer en réponse au comportement humain. Les résultats pourraient aider à éclairer le régime alimentaire des patients et le contrôle des infections dans les hôpitaux.

C. difficile les bactéries peuvent infecter l'intestin et sont la principale cause de diarrhée associée aux antibiotiques dans le monde. Pendant que quelqu'un est en bonne santé et ne prend pas d'antibiotiques, des millions de «bonnes» bactéries dans l'intestin gardent la C. difficile sous contrôle. Cependant, les antibiotiques éliminent les bactéries intestinales normales, laissant le patient vulnérable aux C. difficile infection dans l'intestin. Ceci est alors difficile à traiter et peut provoquer une inflammation de l'intestin et une diarrhée sévère.

Souvent trouvé dans les environnements hospitaliers, C. difficile forme des spores résistantes qui lui permettent de rester sur les surfaces et de se répandre facilement entre les personnes, ce qui en fait un fardeau important pour le système de santé.

Pour comprendre l’évolution de cette bactérie, les chercheurs ont collecté et cultivé 906 souches de C. difficile isolé des humains, des animaux, tels que les chiens, les porcs et les chevaux, et de l'environnement. En séquençant l'ADN de chaque souche, en comparant et en analysant tous les génomes, les chercheurs ont découvert que C. difficile évolue actuellement vers deux espèces distinctes.

Nitin Kumar, première auteure commune du Wellcome Sanger Institute, a déclaré: "Notre analyse génétique à grande échelle nous a permis de découvrir que C. difficile est actuellement en train de former une nouvelle espèce avec un groupe spécialisé dans la diffusion en milieu hospitalier. Cette espèce émergente existe depuis des milliers d'années, mais c'est la première fois que quelqu'un étudie C. difficile génomes de cette manière pour l'identifier. Cette bactérie particulière était prête à tirer parti des pratiques de santé modernes et du régime alimentaire humain avant même que les hôpitaux n'existent. "

Les chercheurs ont découvert que cette espèce émergente, nommée C. difficile Le clade A, représentait environ 70% des échantillons provenant de patients hospitalisés. Il y avait des changements dans les gènes qui métabolisent les sucres simples, alors les chercheurs ont ensuite étudié C. difficile chez les souris et a constaté que les nouvelles souches émergentes colonisaient mieux les souris lorsque leur régime alimentaire était enrichi en sucre. Il avait également développé des différences dans les gènes impliqués dans la formation des spores, offrant une résistance beaucoup plus grande aux désinfectants hospitaliers courants. Ces changements lui permettent de se répandre plus facilement dans les environnements de soins de santé.

L'analyse des rencontres a révélé que C. difficile Clade A est apparu pour la première fois il y a environ 76 000 ans. Le nombre de souches différentes a commencé à augmenter à la fin du XVIe siècle, avant la création d'hôpitaux modernes. Ce groupe a depuis prospéré en milieu hospitalier avec de nombreuses souches qui continuent à s’adapter et à évoluer.

Le Dr Trevor Lawley, auteur principal du Wellcome Sanger Institute, a déclaré: "Notre étude fournit des preuves basées sur le génome et en laboratoire que les modes de vie humains peuvent amener les bactéries à former de nouvelles espèces afin qu'elles se propagent plus efficacement. Nous montrons que les souches de C. difficile Les bactéries ont continué d'évoluer en réponse aux régimes et aux systèmes de santé modernes et ont révélé que se concentrer sur l'alimentation et sur la recherche de nouveaux désinfectants pourrait aider à lutter contre cette bactérie. "

Le professeur Brendan Wren, auteur à la London School of Hygiene & Tropical Medicine, a déclaré: "Cette collection et ce C. difficile Des génomes entiers, provenant de 33 pays à travers le monde, nous donnent une toute nouvelle compréhension de l'évolution des bactéries. Il révèle l'importance de la surveillance génomique des bactéries. En fin de compte, cela pourrait aider à comprendre comment d’autres agents pathogènes dangereux évoluent en s’adaptant aux changements de modes de vie et de régimes de soins de santé humains, qui pourraient ensuite éclairer les politiques de santé.

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